根据一项从2003年开始对超过120万名妇女进行的研究结果显示，巴氏涂片（Pap）联合HPV检测并没有发现比HPV单独检测更多的宫颈癌。Pap仅检测出一小部分在HPV检测中漏掉的初癌患者(3.5%)和癌症(5.9%)。
HPV检测比巴氏试验更敏感，用于检测癌前病变。HPV检测能覆盖已知的致癌病毒，但一些妇科医生因为罕见HPV-阴性、Pap-阳性癌症而进行联合测试，尽管使用这两种测试的费用更高。
总的来说，预诊断HPV检测(76.7%)比细胞学检测(59.1%)更具有临床敏感性。约82%的预诊断检测都是HPV和/或细胞学阳性。经组织病理学诊断，在鳞状细胞癌中，HPV和细胞学检测之间的阳性差异在鳞癌(75.0% vs 69.6%)中比腺癌(79.0% vs 45.4%)更小。
与巴氏试验相比，HPV检测发现更多的妇女随后被诊断为癌症早期和癌症。总的来说，预诊断的HPV检测比细胞学更有可能呈阳性(83.8% vs 61.9%)。几乎有9/10的预诊断性试验(87.3%)HPV和/或细胞学呈阳性。在宫颈上皮内肿瘤3级(83.9% vs 62.8%)和原位腺癌(82.2% vs 53.2%)HPV检测比细胞学阳性率更高。
Mark Schiffma说，两者之间的选择策略和所选择的筛查间隔-三年或五年或者更多，取决于社会判断(如癌症预防效益、资源分配)，而不是科学事实。尽管如此，即使在3年的间隔时间(最常见的使用策略)中使用联合测试，子宫颈癌仍然很少发生(尽管通常是在可无进展生存的阶段)。为了预防每一种病例，过度筛查可能会带来最小的癌症预防效果，同时却增加筛查的危害。
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