结直肠癌ctDNA筛查,五分钟了解结直肠癌ctDNA检测在临床中的应用
"结直肠癌特别适合采用液体活检，因为其循环肿瘤碎片(细胞、DNA和甲基化标志物等)脱落率很高。目前，ctDNA已成为结直肠癌患者个体化管理中一种很有前途的预后性和(可能)预测性生物标志物。"
结直肠癌ctDNA检测在临床中的应用
液体活检，对于临床来说，并不是一个新鲜的概念。
近年来，关于ctDNA和CTC的知识量正呈指数级增长，其中以ctDNA最为突出。在临床上，大多数可用的平台都是基于ctDNA的。
目前，ctDNA的用途已经从最初用于晚期/转移性肿瘤的分子分型和获得性耐药机制检测扩展到早期MRD检测以及癌症早检(包括癌症早筛和早诊)。几项大型研究表明，结直肠癌中的ctDNA脱落率很高，特别适合于液体活检。在结直肠癌中，ctDNA已成为结直肠癌患者个体化管理中一种很有前途的预后生物标志物，而且还可能作为一种预测工具，指导辅助治疗和转移治疗的决策。
今天，我们花五分钟时间了解下ctDNA在结直肠癌中的临床应用：
先来张美图，一览ctDNA在结直肠癌中的临床应用场景：
1、基于NGS平台的ctDNA分子分型
1)在新诊断的转移性结直肠癌中，基于NGS的ctDNA检测可以在诊断时提供相关的分子图谱信息(RAS/RAF/HER2及NTRK状态，MSI和TMB)来代替基于组织的NGS检测，以告知治疗决策。
2、基于NGS平台的ctDNA耐药评估
1)基于NGS的ctDNA检测可以捕获结直肠癌肿瘤内空间和时间异质性，并为那些接受靶向治疗的人群提供一个检测获得性耐药机制的平台(RAS/RAF/EGFR突变，ERBB2扩增，MET扩增及其他基因融合)。
3、基于NGS平台的ctDNA-MRD评估
1) 基于NGS的ctDNA-MRD检测有两种平台：
(a)Tumor-informed平台：对原发肿瘤组织进行测序以鉴定患者的特异基因组变异图谱，然后设计定制个性化多重PCR-NGS的MRD panel进行个性化的ctDNA-MRD检测评估。
(b)Tumor-agnostic平台(或称为Tumor-uninformed 或 Plasma-only ctDNA)：无需原发肿瘤组织，仅依赖于一组预先选定引物/探针设计与癌症类型相关的固定panel(ctDNA+甲基化表观基因组学标志物)进行ctDNA-MRD检测评估。
2)ctDNA已被确定为早期CRC预后生物标志物，可以确定根治性手术后的复发风险。
3)在临床实践中，首次ctDNA-MRD检测评估(即Landmark)应在根治性手术后4周或更长时间以及全身系统治疗完成后2周或更长时间进行。对于后续纵向监测(即Longitudinal)，ctDNA-MRD检测评估通常需要每8-12周进行一次。
4)对于ctDNA-MRD阳性但常规CT影像阴性的结直肠癌患者，应采用另一种形式的影像(MRI/PET-CT)来确定是否有隐蔽性的局部区域残留病灶。
5)新兴数据表明，ctDNA-MRD除了预后标志物外，也可能是辅助治疗反应的预测生物标志物，但仍需要前瞻性随机试验来确定ctDNA-MRD对辅助治疗决策的影响。
6)最后，ctDNA清除率(常用MTM或VAF评估)正在成为一种有助于早期评估治疗效果的生物标志物，但它是否可以作为复发或DFS的替代终点尚待确定。
4、基于表观基因组/甲基化的ctDNA早检(早筛/早诊)平台
1) 结直肠癌特异性筛查;
2) 多肿瘤筛查。
最后，需要重申的是，基于NGS的ctDNA检测有不同类型的平台，每种平台都有其优点和缺点及不同的临床适应症，需要合理进行选择。另外，ctDNA结果的解释和应用不能孤立地进行，除了检测/技术问题外，还需要牢记临床背景。
内容来源:基因talks
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